Sin embargo, tal vez por el profundo conocimiento que existía en su familia acerca de lo que el éxito temprano puede hacerle a una vida, su prioridad nunca dejaron de ser sus estudios, y Highmore se mostró como un estudiante verdaderamente brillante.
Entre 2010 y 2014 obtuvo una doble licenciatura con honores en Español y Árabe en el Emmanuel College de la Universidad de Cambridge, y habla con fluidez varios idiomas más, como francés o portugués.
Muy celoso de su vida personal, en 2021 se comprometió con su pareja, la también actriz Klarissa Munz, y se casaron de manera discreta, al punto de que fueron varios los medios que descubrieron el matrimonio después de verlos a ambos con el anillo puesto.